環保局於107年12月清查本縣原已列管62座公廁，其中馬公港旅客服務中心、天后宮、篤行十村公廁、莒光新村、公車總站、馬公汽車加油站、馬公漁船加油站、觀音亭運動公園、救國團青年活動中心、長青活動中心、南海遊客中心、菊島之星、南海碼頭候船室、澎湖縣立圖書館、生活博物館、東衛石雕公園、澎湖休憩園區、澎湖海洋地質公園中心、澎湖遊客中心、菜園候船室公廁、菜園公廁、風櫃社區、時裡社區、澎南圖書館、澎湖三總分院、湖西汽車加油站、湖西鄉公所、湖西圖書館、湖西加油站、隘門沙灘、隘門社區、馬公機場、林投公園、奎壁山、觀日樓、龍門濱海公園、中屯風車停車場、港子社區、岐頭遊客中心、赤崁漁港加油站、小赤社區、北海遊客中心、白沙圖書館、後寮遊客中心、後寮社區、三十人公廟、跨海大橋、通樑汽車加油站、通樑社區、漁翁島遊客中心、大義宮、小門資訊站、小門地質館、西嶼福利館、池東加油站、二崁公廁、西嶼鄉立圖書館、大池治安宮、西臺遊客中心、外垵兩用加油站、東昌營區、內垵遊憩區等皆為優等級。
環保局表示因澎湖縣一直以來即是以觀光遊憩為主，每年均會有觀光客蒞澎旅遊，為了使遊客能有下次再來的好印象，所以提供優質整潔的公廁環境是必要之重要事項之一，故環保局特籲請各管理單位針對所轄列管公廁務必落實督導管理與維護，並加強宣導衛生紙丟馬桶，透過此一政策推動期使改善廁間內臭味、細菌及蚊蠅孳生等環境衛生問題，共同為本縣觀光門面來把關，期使讓每位遊客都能有清新的如廁環境。