為了改善花蓮農業基礎設施，立法委員蕭美琴積極向農委會農田水利處爭取多項修建工程計畫經費，針對農田水利設施更新改善、灌區外農田水利設施更新改善，以及農地重劃區緊急農水路改善等三方面規畫實施，執行時間橫跨107及108年，已於今年度獲逾三千八百萬元補助，修建實施地區涵蓋吉安鄉至玉里鎮，各項工程當前陸續進行中。
吉安鄉干城一街及光華村一帶的溝渠長期存在灌溉用水和區域排水間雜的問題，維護與管理權責難以釐清。蕭美琴經過會勘後，與相關單位協商切割農田水利灌排的治理範圍，區分農田排水和區域排水，釐清農田水利會及縣政府的管理權責，並整體規劃通水斷面流量需求，改善水溝設施，以利後續工程進行。
此外，考量到玉里大多數農地是良田，蕭美琴也要求將良田納入。在玉里三民迪家圳和河東地區太平渠，由於多數基礎水利設施於早期八十年代規畫，已不符現在需求，加上擴大灌區後的供水量也不足，因此蕭美琴要求有關單位重新思考農地對灌溉用水的需求量，本次也納入改善計畫，規劃擴大供水設施規模。
針對壽豐豐田及鳳林平林等地，由於部分道路邊緣的溝渠較寬，為顧及農間行車安全，提升農路周邊水利設施的安全性，蕭美琴要求調整溝渠寬度或設置安全護欄。上述工程計畫經費皆已核定，蕭美琴說，感謝農田水利處的協助，工程施作完成後，不僅可提昇農地生產環境，也希望有效降低淹水發生次數、範圍及時間，讓農民安心。